Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Genomic characterization and pathogenicity of vibrio penaeicida strains isolated from kuruma shrimp penaeus japonicus /
المؤلف
Ragab, Wafaa Mohamed Abd El-Kader.
هيئة الاعداد
باحث / وفاء محمد عبدالقادر رجب
مشرف / هيرونو ايكو
مشرف / كوندو هيديهيرو
مشرف / كاتاجيرى تاكايوكى
باحث / سانو موتوهيكو
الموضوع
penaeus japonicus.
تاريخ النشر
2022.
عدد الصفحات
online resource (204 pages) :
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
البيطري
تاريخ الإجازة
1/1/2022
مكان الإجازة
جامعة المنصورة - كلية الطب البيطرى - قسم البكتريا والفطريات والمناعة
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 204

from 204

Abstract

يعتبر جمبرى الكوروما أحد أهم أنواع الجمبرى المستزرع من الناحية الاقتصادية فى اليابان وتمثل محافظة أوكيناوا أكبر منتج لجمبري الكوروما . تم التعرف على عدد م ن الأمراض البكتيرية والفيروسية المختلف ة كأمراض معدية رئيسية في مزارع جمبري الكوروما ويعتب رالمرض الذى تسببه عائلة الفيبريو من أخطر الأمراض البكتيرية في تربية الأحياء المائية البحرية. هذا المرض ينتج خسائر اقتصادية فادحة بسبب ارتفاع معدل النفوق الناجم عن العدوى في القشريات المائية خاصة خلال مراحل حياتها المبكرة. منذ عام 1980 ، تم تسجيل تفشٍ حالات مصابة ب الفيبريو في مزارع جمبري الكوروما مما أدى إلى خسائر ملحوظة في صناعة الجمبري. ويعتبر فيبريو بينايسيدا واحد من أهم أنواع عائلة الفيبريو التى تسببت فى خسائر اقتصادية فى دولتى اليابان ونيوكاليدوني ا ، لذلك التعرف والتوصيف الدقيق لهذا الميكروب أمر هام جدا فى التشخيص الصحيح للمرض وعلاجه. طبقا لما سبق فان هذه الدراسة تهدف الى معرفة وتوصيف الجينوم الخاص بهذا الميكروب وكذلك تقييم قدرته الامراضية. فى هذه الدراسة تم عزل 9 سلالات من بكتريا فيبريو بينايسيدا من حدثين للنفوق الجماعى فى مزرعة جمبرى الكوروما فى محافظة أوكيناوا عام 2019 من محتويات الامعاء الخاصة بهم بالطرق التقليدية التى أكدت ايجابية هذه المعزولات للفيبريو بينايسيدا وبعد ذلك تم تأكيد هذه المعزولات باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل والتسلسل الجينى لجينات 16SrRNA & Vpen-hemolysin. بعد ذلك، لاكتساب نظرة ثاقبة للسمات الوراثية ومدى القدرة ال مراضية لفيبريو بينايسيدا، تم اختيار سلالتين بشكل عشوائى لتمثيل كل حالة وفاة جماعية وتم شراء 3 سلالات تاريخية من مركز للموارد البيولوجية لدراسة تطور هذا الميكروب. بعد ذلك تم استخراج الحمض النووى لهذه السلالات لدراسة الجينوم الخاص بها من خلال التسلسل الجينى الكامل وكشفت النتائج أن كل سلالات الفيبريو بينايسيدا تملك 2 من الكروموسومات ،الكروموسوم الاول يترواح عدد النيوكليوتيدات به من 4.1 الى 4.3 مليون قاعدة والكروموسوم الثانى يتراوح عدد النيوكليوتيدات به من 2.2 الى 2.4 مليون قاعدة. 4 من السلالا ت تملك بلازميد و 2 من السلالات تملك جينات مقاومة للمضاد الحيوى تتراسيكلين والتى تم اثباتها باستخدام اختبار الحساسية أيضا. أشارت الدراسة أيضا الى أن السلالات الخمس تملك عددا من جينات الضراوة المسئولة عن الحركة والانجذاب الكيميائى وامتصاص واكتساب الحديد وافراز السموم ومضادات البلعمة.للتعرف على الانواع ذات الصلة الوثيقة من فيبريو بينايسيدا تم انشاء شجرتين للتطور. أظهرت الشجرة الاولى الناتجة أن جميع السلالات تم تقسيمها الى 16cladesحيث ينتمى فيبريو بينايسيدا الى Nigripulchritudo cladeوأظهرت الشجرة الاولى أن جميع السلالات انقسمت الى ثلاث مجموعات.تم أيضا تحديد قدرة فيبريو بينايسيدا على افراز بعض الانزيمات التى تشمل الهيموليسين والكازيناز والاميلاز وأظهرت النتائج أن جميع السلالات تقريبا تملك نفس القدرة. وبعد ذلك تم تحديد قدرت السلالات على تكوين.البيوفيلم وأثبتت النتائج أن جميع السلالات تملك نفس القدرة ماعدا سلالة واحدة تملك قدرة أعلى لتكوين البيوفيلم.باختصار فان هذه الدراسة تقدم أول تحليل مقارن لجينوم الفيبريو بينايسيدا وستكون هذه النتائج مفيدة لفهم السماتا لوراثية ، والتسبب المرضي ، وتميز النشوء والتطور لهذا العامل الممرض.